Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms