Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms