Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMP1P11279 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms