Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms