Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMC1P11047 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms