Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GLI4P10075 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms