Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00032P0C843 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms