Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFLP07196 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFLP07196 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms