Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX3O95343 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX3O95343 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIX3O95343 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIX3O95343 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIX3O95343 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIX3O95343 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms