Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX4O95219 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX4O95219 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms