Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms