Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMDSO60547 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMDSO60547 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms