Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCEO43556 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCEO43556 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms