Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms