Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCKDKO14874 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms