Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms