Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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