Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM247A6NEH6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM247A6NEH6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms