Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms