Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms