Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP3Q9Y446 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms