Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF13BQ9Y275 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms