Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD1BQ9UPS6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms