Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF8Q9UPP1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms