Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms