Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms