Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM5BQ9UGL1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms