Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT172Q9UG01 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT172Q9UG01 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms