Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms