Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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