Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL9Q9P2J3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms