Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms