Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms