Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms