Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms