Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHST11Q9NPF2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms