Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR4Q9NPB9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms