Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms