Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-5Q9HDB9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms