Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD42

CHMP1A, Charged multivesicular body protein 1a, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1AQ9HD42 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHMP1AQ9HD42 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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