Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms