Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCCC2Q9HCC0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms