Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCL11BQ9C0K0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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