Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms