Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCO2Q9BYV7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms