Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms