Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms