Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCD2Q9BXW9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCD2Q9BXW9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms