Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB11FIP5Q9BXF6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms