Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BBS2Q9BXC9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms